本科業務範圍包括門診、病房及各項檢查工作,如:上消化道內視鏡〈胃鏡〉、小腸鏡、大腸鏡、乙狀結腸鏡、膠囊內視鏡、經內視鏡逆行性膽胰管造影術、腹部超音波、內視鏡超音波檢查等。
本科除提供門診服務、住院醫療照顧及常規性檢查治療外,更積極從事研究與教學工作,定期舉辦民眾醫療衛教、學術研討會、及國內外學術交流,以嘉惠中部地區病患。