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本組於1999年6月由檢驗醫學部成立至今20年。成立之初人員編制為二人，主要提供的服務項目為海洋性貧血基因檢查及快速的感染性基因檢查(CMV, HSV, TB……等PCR)。在SARS期間，蔡長海董事長擔任中部地區SARS抗疫指揮官，指定本部受理其他醫院送來疑似SARS的檢體，協助中部各醫院診斷SARS之病患。因此本組利用「反轉錄?聚合?連鎖反應法」從疑似感染SARS病人的檢體中檢驗是否有冠狀病毒存在，協助各醫院的診斷。經過不斷的努力與進步下，於2007年12月，在彭慶添教授領導下，本組更通過「海洋性貧血」基因篩檢中心評鑑，成為全國七家核可醫療院所之一，更是中部六縣市唯一檢測確認機構。之後，為了因應不斷成長的業務量，在2010年5月本組擴編為分子診斷中心分生組,服務範圍更擴大至個人化醫療相關基因檢測,未來希望能為民眾提供更快速更準確的基因檢測，使民眾能得到更好的個人化醫療照護。2020年1月起本組為衛生福利部疾病管制署SARS-CoV-2病毒核酸檢驗合約實驗室。2022年1月起檢驗醫學部組織重整，本組隸屬於微生物科分子檢驗組，編制組長一名及組員四名。

服務項目：檢驗項目包括HLA相關基因、感染性檢驗、移植檢驗：

一、HLA相關基因如：HLA*B27, HLA*B15:02, HLA*B58:01。

二、感染性微生物之分子生物檢驗(如：SARS-CoV-2、CMV、 HSV、EBV、Parvovirus B19、EV、PJP、HPV、CT/NG、HBV mutant、 HCV genotype、HBV病毒定量、HCV病毒定量、HIV病毒定量、CMV病毒定量、EBV病毒定量及BK病毒定量)等十多項檢驗。

三、移植檢驗(HLA-A/B/C，HLA-DR/DQ)

四、協助衍生企業細胞製品黴漿菌基因檢驗。